MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Metallosphaera sedula DSM 5348 chromosome

Total Repeats: 38750

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_009440	CAA	2	6	286268	286273	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146303114
5002	NC_009440	TAA	2	6	286283	286288	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146303114
5003	NC_009440	GGT	2	6	286314	286319	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146303114
5004	NC_009440	GAG	2	6	286353	286358	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146303114
5005	NC_009440	GAG	2	6	286389	286394	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146303114
5006	NC_009440	GAA	2	6	286458	286463	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146303114
5007	NC_009440	AGG	2	6	286502	286507	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146303114
5008	NC_009440	TTA	2	6	286625	286630	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146303115
5009	NC_009440	GAT	2	6	286645	286650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146303115
5010	NC_009440	TAGT	2	8	286652	286659	25 %	50 %	25 %	0 %	146303115
5011	NC_009440	GA	3	6	286692	286697	50 %	0 %	50 %	0 %	146303115
5012	NC_009440	TGG	2	6	286713	286718	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146303115
5013	NC_009440	ACC	3	9	286804	286812	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146303115
5014	NC_009440	GCG	2	6	286844	286849	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146303115
5015	NC_009440	GTA	2	6	286860	286865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146303115
5016	NC_009440	CGTTC	2	10	286914	286923	0 %	40 %	20 %	40 %	146303115
5017	NC_009440	CTC	2	6	286971	286976	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146303115
5018	NC_009440	TCC	2	6	287018	287023	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146303115
5019	NC_009440	AGG	2	6	287045	287050	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146303115
5020	NC_009440	GGTTAC	2	12	287052	287063	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	146303115
5021	NC_009440	GTA	2	6	287109	287114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146303115
5022	NC_009440	TAG	2	6	287238	287243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146303115
5023	NC_009440	TGG	2	6	287285	287290	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146303115
5024	NC_009440	GA	3	6	287291	287296	50 %	0 %	50 %	0 %	146303115
5025	NC_009440	AGG	2	6	287509	287514	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146303115
5026	NC_009440	TCCC	2	8	287516	287523	0 %	25 %	0 %	75 %	146303115
5027	NC_009440	AGG	2	6	287614	287619	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146303115
5028	NC_009440	AGG	2	6	287644	287649	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146303115
5029	NC_009440	GGA	2	6	287793	287798	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146303115
5030	NC_009440	TGA	2	6	287906	287911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146303115
5031	NC_009440	ATT	2	6	287932	287937	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146303115
5032	NC_009440	TGA	2	6	287954	287959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146303115
5033	NC_009440	AGG	2	6	288001	288006	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146303115
5034	NC_009440	GTT	2	6	288026	288031	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146303115
5035	NC_009440	TCG	2	6	288254	288259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146303115
5036	NC_009440	AATCTC	2	12	288267	288278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146303115
5037	NC_009440	CAC	2	6	288288	288293	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146303115
5038	NC_009440	CGTTC	2	10	288321	288330	0 %	40 %	20 %	40 %	146303115
5039	NC_009440	ACG	2	6	288352	288357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146303115
5040	NC_009440	TA	3	6	288512	288517	50 %	50 %	0 %	0 %	146303115
5041	NC_009440	AAC	2	6	288565	288570	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146303115
5042	NC_009440	ACT	2	6	288589	288594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146303115
5043	NC_009440	TTA	2	6	288610	288615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5044	NC_009440	CAC	2	6	288616	288621	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5045	NC_009440	T	6	6	288622	288627	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5046	NC_009440	CGA	2	6	288647	288652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5047	NC_009440	TCC	2	6	288669	288674	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5048	NC_009440	GTG	2	6	288732	288737	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5049	NC_009440	TA	3	6	288793	288798	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5050	NC_009440	TTA	2	6	288842	288847	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5051	NC_009440	AGT	2	6	288855	288860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146303116
5052	NC_009440	GAG	2	6	288967	288972	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146303116
5053	NC_009440	ACT	2	6	289183	289188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146303116
5054	NC_009440	CAG	2	6	289191	289196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146303116
5055	NC_009440	AG	3	6	289293	289298	50 %	0 %	50 %	0 %	146303116
5056	NC_009440	GTG	2	6	289342	289347	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146303116
5057	NC_009440	AC	3	6	289367	289372	50 %	0 %	0 %	50 %	146303116
5058	NC_009440	AAT	2	6	289395	289400	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146303116
5059	NC_009440	A	6	6	289411	289416	100 %	0 %	0 %	0 %	146303116
5060	NC_009440	AGCTG	2	10	289452	289461	20 %	20 %	40 %	20 %	146303116
5061	NC_009440	GAA	2	6	289491	289496	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146303116
5062	NC_009440	GGGA	2	8	289556	289563	25 %	0 %	75 %	0 %	146303116
5063	NC_009440	CTT	2	6	289601	289606	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146303117
5064	NC_009440	ATCC	2	8	289656	289663	25 %	25 %	0 %	50 %	146303117
5065	NC_009440	GTT	2	6	289688	289693	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146303117
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5067	NC_009440	AGA	2	6	289954	289959	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146303117
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5069	NC_009440	CAA	2	6	290049	290054	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146303117
5070	NC_009440	GTT	2	6	290147	290152	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146303117
5071	NC_009440	ATA	2	6	290316	290321	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146303117
5072	NC_009440	CAA	2	6	290330	290335	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146303117
5073	NC_009440	G	6	6	290564	290569	0 %	0 %	100 %	0 %	146303118
5074	NC_009440	ATGT	2	8	290573	290580	25 %	50 %	25 %	0 %	146303118
5075	NC_009440	GAG	2	6	290609	290614	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146303118
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5078	NC_009440	TATG	2	8	290782	290789	25 %	50 %	25 %	0 %	146303118
5079	NC_009440	ATG	2	6	290802	290807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146303118
5080	NC_009440	CAG	2	6	290842	290847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146303118
5081	NC_009440	GAG	2	6	290920	290925	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146303118
5082	NC_009440	TC	3	6	290926	290931	0 %	50 %	0 %	50 %	146303118
5083	NC_009440	ACTC	2	8	290937	290944	25 %	25 %	0 %	50 %	146303118
5084	NC_009440	GAG	2	6	290987	290992	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146303118
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5087	NC_009440	GGA	2	6	291136	291141	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146303118
5088	NC_009440	CTA	2	6	291202	291207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146303118
5089	NC_009440	CGG	2	6	291264	291269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146303118
5090	NC_009440	TGA	2	6	291420	291425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146303118
5091	NC_009440	CAGC	2	8	291438	291445	25 %	0 %	25 %	50 %	146303118
5092	NC_009440	GTT	2	6	291475	291480	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146303118
5093	NC_009440	GGAG	2	8	291532	291539	25 %	0 %	75 %	0 %	146303118
5094	NC_009440	AG	3	6	291538	291543	50 %	0 %	50 %	0 %	146303118
5095	NC_009440	AG	3	6	291579	291584	50 %	0 %	50 %	0 %	146303118
5096	NC_009440	GTGAT	2	10	291626	291635	20 %	40 %	40 %	0 %	146303118
5097	NC_009440	CA	3	6	291687	291692	50 %	0 %	0 %	50 %	146303119
5098	NC_009440	GT	3	6	291746	291751	0 %	50 %	50 %	0 %	146303119
5099	NC_009440	GA	3	6	291767	291772	50 %	0 %	50 %	0 %	146303119
5100	NC_009440	GTG	2	6	291816	291821	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146303119
5101	NC_009440	GAGG	2	8	291869	291876	25 %	0 %	75 %	0 %	146303119
5102	NC_009440	TAT	2	6	291946	291951	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146303120
5103	NC_009440	GA	3	6	292037	292042	50 %	0 %	50 %	0 %	146303120
5104	NC_009440	TAT	2	6	292099	292104	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146303120
5105	NC_009440	CCT	2	6	292112	292117	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146303120
5106	NC_009440	GAC	2	6	292184	292189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146303120
5107	NC_009440	AAC	2	6	292199	292204	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146303120
5108	NC_009440	AGG	2	6	292310	292315	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146303120
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5110	NC_009440	CCAG	2	8	292421	292428	25 %	0 %	25 %	50 %	146303120
5111	NC_009440	TCA	2	6	292437	292442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146303120
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5114	NC_009440	AG	3	6	292633	292638	50 %	0 %	50 %	0 %	146303120
5115	NC_009440	TGG	2	6	292651	292656	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146303120
5116	NC_009440	CT	3	6	292679	292684	0 %	50 %	0 %	50 %	146303120
5117	NC_009440	TTCA	2	8	292763	292770	25 %	50 %	0 %	25 %	146303120
5118	NC_009440	C	6	6	292775	292780	0 %	0 %	0 %	100 %	146303120
5119	NC_009440	GTTAA	2	10	292805	292814	40 %	40 %	20 %	0 %	146303120
5120	NC_009440	TGA	2	6	292831	292836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146303120
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5122	NC_009440	TGA	2	6	293073	293078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146303120
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5124	NC_009440	AGT	2	6	293102	293107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146303120
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5244	NC_009440	GATC	2	8	300663	300670	25 %	25 %	25 %	25 %	146303130
5245	NC_009440	CACAT	2	10	300674	300683	40 %	20 %	0 %	40 %	146303130
5246	NC_009440	TTTC	2	8	300703	300710	0 %	75 %	0 %	25 %	146303130
5247	NC_009440	TCA	2	6	300726	300731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146303130
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5249	NC_009440	CATA	2	8	300826	300833	50 %	25 %	0 %	25 %	146303130
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5251	NC_009440	AAT	2	6	300889	300894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5252	NC_009440	AT	3	6	300911	300916	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5253	NC_009440	TGT	2	6	300965	300970	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5277	NC_009440	TAT	3	9	302072	302080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5370	NC_009440	CT	3	6	307529	307534	0 %	50 %	0 %	50 %	146303138
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5373	NC_009440	CTT	2	6	307625	307630	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146303139
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5375	NC_009440	TA	3	6	307747	307752	50 %	50 %	0 %	0 %	146303139
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5377	NC_009440	TTTA	2	8	307804	307811	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5378	NC_009440	ATT	2	6	307828	307833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5379	NC_009440	TAAAT	2	10	307844	307853	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5380	NC_009440	TTA	2	6	307906	307911	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146303140
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5409	NC_009440	CAT	2	6	309456	309461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5410	NC_009440	TAA	2	6	309470	309475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5411	NC_009440	ATA	2	6	309484	309489	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5412	NC_009440	ATTTTA	2	12	309499	309510	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5414	NC_009440	TAT	2	6	309562	309567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5470	NC_009440	TA	3	6	312997	313002	50 %	50 %	0 %	0 %	146303144
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5482	NC_009440	T	6	6	313508	313513	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5483	NC_009440	GTC	2	6	313605	313610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146303145
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5485	NC_009440	ATC	2	6	313798	313803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5486	NC_009440	TAA	2	6	313820	313825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5487	NC_009440	CTGT	2	8	313828	313835	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5488	NC_009440	A	6	6	313845	313850	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5489	NC_009440	CAA	2	6	313882	313887	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5490	NC_009440	AG	3	6	313919	313924	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5491	NC_009440	CCG	2	6	313953	313958	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5492	NC_009440	TA	3	6	313991	313996	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5493	NC_009440	ATA	2	6	314010	314015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5494	NC_009440	TTA	2	6	314018	314023	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5495	NC_009440	TTAAAA	2	12	314031	314042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5496	NC_009440	AG	3	6	314052	314057	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5497	NC_009440	ATT	2	6	314095	314100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5498	NC_009440	TAAA	2	8	314136	314143	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5499	NC_009440	CTA	2	6	314148	314153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5500	NC_009440	TTA	2	6	314169	314174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

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